Libros: 

• El jefe político. Un dominio negociado en el mundo rural del Estado de México, 1856-1911. El Colegio de México, El Colegio de Michoacán y CIESAS, 2015.
• Historias desde los márgenes. Senderos hacia el pasado de la sociedad mexicana. Antologías, El Colegio de México, 2011.
• México descalzo. Estrategias de sobrevivencia frente a la modernización liberal, México, Plaza y Janés, 2002.
• Las naciones de una república. La cuestión indígena en las leyes y el congreso mexicanos, 1867-1876, México, Biblioteca Parlamentaria de México, Congreso de la Unión, 1999.
• Las rasgaduras de la descolonización. Españoles y mexicanos a mediados del siglo XIX, México, El Colegio de México, 1996.
• Revolución y caciquismo. San Luis Potosí. (1910-1938), México, El Colegio de México, 1984.

Artículos y capítulos de libros recientes 

• "Ocurrimos a cogernos bajo las alas de su protección. Disputas plebeyas frente al estado nacional en la segunda mitad del siglo XIX" en: Buve, Falcón, Escobar (coords); La arquitectura histórica del poder: naciones, nacionalismos y estados en América Latina, CEDLA-COLMEX, (2010).
• "Descontento plebeyo. Resistencias y propuestas de obreros y campesinos mexicanos a fines del siglo XIX", en Leticia Reina Aoyama y Antonio Escobar Ohmstede, ¿Fin de siglos y fin de ciclos? 1810, 1910, 2010, CIESAS y DEH-INAH, (en prensa).
• "Polifonía de voces y acciones subalternas. Reflexiones desde el México decimonónico", Homenaje a Adolfo Gilly, Editorial Era, (en prensa).
• "Vínculos profundos y afectivos. Saturnino Cedillo y sus bases de apoyo campesino" en Carlos Martínez Assad (coord.), El camino de la rebelión del general Saturnino Cedillo, México, Océano, 2010.
• "Pueblos comuneros en una era de transición. Contrapuntos entre el imperio y la república", en Josefina Vázquez (coord.), Juárez. Historia y mito, México, El Colegio de México, 2010.